cofs0=d:\
cofs1=c:\
cofs0 /mnt/d cofs defaults,uid=username 0 0
cofs1 /mnt/c cofs defaults,uid=username 0 0
settings.txt を変更した後は Windows を再起動しないと設定が読み込まれなくてはまった。Xming.exe あたりのプロセスを再起動したらいいと思うんだけど。
追記
{andlinuxインストールフォルダ}/srvstop.bat
{andlinuxインストールフォルダ}/srvstart.bat
あたりを実行すれば良かったのかな。